Athens Township, Kansas adquirió entidad administrativa propia el 10 de agosto de 1872, tras su separación de Limestone Township, en un momento de reorganización territorial ligado a la expansión agraria del norte de Kansas. La ocupación efectiva del territorio se había iniciado algunos años antes, hacia 1870, impulsada por la calidad de las tierras y por la disponibilidad de agua en torno a Limestone Creek y sus ramificaciones. Desde sus primeras etapas, el asentamiento dispuso de formas básicas de gobierno local, junto con escuelas y comunidades religiosas, rasgos característicos de un poblamiento rural estable, aunque de reducida densidad demográfica.