En 1857, se le encomienda por el rectorado de la Universidad de Salamanca la sustitución de la cátedra de teoría de los procedimientos judiciales y práctica forense. Nombrado asimismo en aquella fecha «sustituto anual» de las asignaturas de economía política y estadística y derecho político y administrativo español. Al año siguiente, en 1858, continúa desempeñando los mismos cargos. Abandona, con bastante probabilidad, la docencia y la carrera universitaria durante un tiempo para dedicarse a quehaceres prácticos de la profesión, principalmente la abogacía.

En noviembre de 1865 solicita tomar parte en oposiciones a cátedras supernumerarias vacantes en las universidades de Barcelona, Granada, Oviedo, Salamanca, Santiago y Zaragoza.

En 1868, todavía en Salamanca, sustituye las cátedras de derecho político y administrativo, derecho político de los principales Estados, economía política y estadística, instituciones de hacienda pública y legislación comparada. En ese mismo año, el claustro de la facultad le nombra auxiliar de la cátedra de derecho mercantil y legislación de aduanas. Con igual estatuto, se encarga también, en la sección de administración, de las asignaturas de derecho civil español y de derecho mercantil y penal. También como auxiliar, en 1869, desempeña las cátedras de teoría y práctica de la redacción de instrumentos públicos y actuaciones judiciales de la carrera del notariado y de derecho mercantil y legislación de aduanas. En 1870, se encarga como auxiliar de la enseñanza de derecho civil, común y formal. En el curso siguiente, de 1871-72, «á invitación del Rectorado», sirve gratuitamente esta cátedra.

En hoja de servicios fechada en mayo de 1877, afirma haber «tomado parte en las oposiciones á Cátedras de Ampliación de Derecho civil vacantes en varias Universidades, ocupando un tercer lugar en las ternas formadas al efecto». Con ello, por lo que refleja la documentación de su expediente, hace referencia a su participación, en la primavera de 1868, en las oposiciones a la citada cátedra, vacante en las universidades de Santiago, Salamanca y Granada, y entre febrero y abril de 1874, en las oposiciones para idéntica plaza en las universidades de Barcelona y Oviedo. Se presentó igualmente, en 1873, a las oposiciones a cátedra de derecho romano, vacante en las universidades de Sevilla, Granada, Salamanca y Santiago. Concurrió también, entre octubre y diciembre de 1875, a los ejercicios de oposición a la cátedra de derecho político y administrativo vacante en la Universidad de Salamanca.

Nombrado el 26 de noviembre de 1872, por el claustro de la facultad salmantina, auxiliar de la asignatura de ampliación de derecho civil, puesto del que cesó el 31 de enero de 1873 por el nombramiento del catedrático titular de la misma. El 5 de febrero, obtiene igual nombramiento con destino a la cátedra de legislación comparada, renunciando al cargo el 30 de septiembre siguiente. Durante el curso 1872-73 sustituye también la asignatura de derecho romano. De nuevo por el claustro de la facultad, a comienzos del curso 1873-74, resulta nombrado auxiliar de la cátedra de derecho civil español, común y formal, cargo que desempeñó hasta el 5 de septiembre de 1875, por supresión de ese tipo de auxiliarías en virtud de decreto de 25 de junio de ese mismo año. Poco antes, por real orden de 27 de agosto de 1875, es nombrado profesor auxiliar de la facultad de derecho de la Universidad de Salamanca.

En 1876, gana por oposición la cátedra de «Disciplina general de la Iglesia y particular de España» en la Universidad de Salamanca. Fue propuesto por el tribunal de oposiciones en primer lugar. Nombrado por real orden de 17 de marzo de 1876, toma posesión el 29 del propio mes.

Nombrado por concurso, el 8 de marzo de 1877, catedrático de «Ampliación de Derecho civil y códigos españoles» de la Universidad de Salamanca. Tras una reforma del plan de estudios, se le confirma como catedrático numerario de «Derecho Civil español, común y foral» de la Universidad de Salamanca, el 25 de septiembre de 1884. Poco antes, en noviembre de 1883, solicitó presentarse al concurso convocado para proveer las cátedras de historia general del derecho español vacantes en la Universidad Central y en la de Valladolid.

En virtud de concurso de traslado, en el que participa como único aspirante, nombrado catedrático de «Derecho Civil español, común y foral» en la Universidad de Barcelona, el 10 de junio de 1886. Mediando concesión de prórroga, toma posesión del puesto el 28 de septiembre. En diciembre de ese mismo año 1886 solicita concursar para la provisión de la cátedra de instituciones de derecho canónico, vacante en la Universidad Central. No prosperó su pretensión de trasladarse a Madrid. Enseñará en Barcelona hasta su jubilación.

Jubilado por el real decreto de 26 de octubre de 1900, que aplicaba la previsión dictada días antes de jubilación de todos los profesores con setenta años cumplidos. Al día siguiente, recurre su jubilación ante el ministerio solicitando que se le realicen las preceptivas pruebas de aptitud y alegando lo siguiente: «El que suscribe lleva 43 años prestando servicios á la enseñanza: ni un solo día, en su larga carrera, ha faltado a sus deberes; y ha gozado de tan excelente salud, que solo una ligera dolencia de ocho días ha sufrido en tan largo espacio de tiempo. Público es además, y por lo mismo de fácil comprobación, que no hay actualmente en la Universidad quien le aventaje en la puntual observancia de sus obligaciones. ¿En qué puede por lo tanto fundarse su jubilación? En imposibilidad física ó intelectual para la enseñanza no puede ser; pues probárase, cuando quiera, que posee en el actual momento ambas aptitudes». El 6 de mayo de 1901, el Claustro estima su petición de regresar al servicio activo pese a haber sido jubilado porque «goza de completa salud corporal» y su «inteligencia conserva todo el vigor y la lozanía de la juventud, en términos que durante los últimos años ha sido modelo de puntualidad y celo en el desempeño de su cargo».

En un comienzo, Falcón recurrió el real decreto que supuso su jubilación ante el tribunal de lo contencioso administrativo del Consejo de Estado, en la convicción de que contrariaba el art. 170 de la ley de instrucción pública, que «asegura al profesor la propiedad de su cátedra, prometiéndole que nunca será privado de ella, si él no dá personalmente motivo para decretar la separación», y el art. 52 del «Reglamento de 15 de enero de 1870», según el cual «la jubilación forzosa solo podrá imponerse al profesor, cuando se pruebe, oyendo al interesado, informando los Jefes de los establecimientos y oyendo al Consejo Universitario, que el profesor cumplió 60 años y no puede seguir ejerciendo el profesorado con provecho de la enseñanza», pero desistió finalmente de su recurso, por lo que el citado tribunal lo declaró «apartado y desistido» de la causa en agosto de 1901, extinguiéndose con ello el pleito. De cualquier modo, tal controversia se hace innecesaria a la vista de sus intereses particulares porque, atendiéndose a su petición, se le retorna al servicio activo, a propuesta del Consejo de Instrucción Pública, de 31 de mayo de 1901.