1937, 26 de febrero. Se incoa expediente de depuración. Un informe del gobierno civil de Oviedo lo define como “católico, pero de los que discuten hasta el Soberano Pontífice. Carácter terco y tenaz. No parece tener gran afición a la función docente de la Cátedra… al menos en Universidades tan lejanas de Madrid como esta”. El S.I.M. lo considera “derechista y persona de absoluta confianza”. Por su parte, el rectorado de Oviedo advierte su “gran cultura filosófica. Inclinado a prolongar las vacaciones”; en el capítulo de ‘conducta política y social’ se recoge que “comulga con la doctrina social de la Iglesia… anticomunista, antifascista y antirracista... Pertenecía al partido de Derecha liberal republicana… Admirador en materias sociales y jurídico-filosóficas de los dominicos, singularmente del P. Rutten, P. Delos, P. Renard y P. Getino”. Un “particular” informa que “trabajó por el indulto de Teodomiro Menéndez y González Peña, siendo absolutamente contrario a todo sistema de Gobierno que no sea liberal. Discípulo predilecto de Ossorio y Gallardo”. Este último informe resultó decisivo, pues el asunto del indulto y la relación con Ossorio y Gallardo, así como la unánime declaración sobre su paradero desconocido, son los principales cargos que se formulan en su contra.

1937, 17 de mayo. La comisión depuradora propone la separación definitiva del servicio, con inhabilitación para cargos directivos y de confianza.

1937, 16 de septiembre. Se dirige por carta a José Gaos, Presidente de la Junta Delegada de Relaciones Culturales, en protesta por el decreto de 27 de septiembre, 1936, que le suspendía del ejercicio de las funciones docentes; en un sentido tono democrático y pacifista, denuncia además la exigencia, para proceder a la readmisión de funcionarios (Orden de 29 de septiembre), de responder a un cuestionario político y sindical (“nunca, ni aun la Monarquía dictatorial, mucho menos la República democrática, me obligó a declarar a qué partido pertenecía, ni si estaba afiliado a algún sindicato o inscrito en otras asociaciones… Si mi conciencia me prohíbe dedicarme a cazar a mis hermanos en el frente –en ningún frente– me veda por lo mismo cualquier labor de propaganda en el llamado ‘frente cultural’… desde el que se impulsa a los demás a la matanza, bien pertrechados de odio”).

1937, 24 de septiembre. El Presidente de la Junta Técnica del Estado acepta la propuesta de la comisión depuradora y es separado del servicio e inhabilitado.